Fylogenetiske treet & Lyme Disease

Lyme sykdom er en lidelse forårsaket av bakterien Borrelia burgdorferi , et patogen som overføres av blacklegged flått . Som med mange andre patogener , har biologer vært i stand til å løse litt av B. burgdorferi evolusjonære historie gjennom genetisk analyse . En fylogenetisk tre for en bakterie som B. burgdorferi gir en visuell illustrasjon av sine relasjoner med andre stammer og arter . Fylogenetiske trær

En fylogenetisk tre viser de evolusjonære relasjonene mellom ulike arter . Hver " node " på tre representerer fremveksten av en ny art , og hvis to artene kan spore sitt opphav tilbake til en enkelt node , representerer denne noden det siste punktet i tid at disse to artene delte en felles stamfar . Disse trærne er konstruert basert på fysiske og genetiske egenskaper , og evolusjonære biologer blir ofte tvunget til å endre dem når nye data kommer frem i lyset .
Borrelia

Borrelia er faktisk en art av bakterier som inkluderer flere arter. Antallet Borrelia arter har økt flere ganger i løpet av de siste to tiårene som flere stammer ble identifisert . Definere arter av Borrelia eller andre slekt av bakterier er faktisk et veldig vanskelig problem . Der planter og dyr er bekymret , har biologer tradisjonelt definert arter basert på deres manglende evne til å avle og produsere fruktbart avkom . En hest og esel kan avle , for eksempel , men for muldyret som resulterer er steril , så hester og esler er separate arter . Bakterier imidlertid reprodusere aseksuelt , så denne definisjonen er irrelevant . Følgelig , for Borrelia og for mange andre bakterier , mikrobiologer definere arter som tydelig basert på en teknikk som kalles hel DNA - DNA hybridisering .
Relasjoner arkiv

Forskere har konstruerte fylogenetiske trær for Borrelia arter basert på en teknikk som kalles multilocus sekvens analyse ( MLSA ) , som ser på forskjeller mellom spesifikke " housekeeping " gener som er tilstede i alle de forskjellige arter. Biologer bruke denne programvaren til å bygge den "mest parsimonious tree" - Fylogenetisk tre som krever færrest evolusjonære endringer for å forklare de observerte forskjellene . Resultater fra denne metoden , men ofte måtte justeres når ny informasjon blir tilgjengelig .
Relasjoner

tiden , aksjer B. burgdorferi sensu strengt tatt sin siste felles stamfar med B. bissettii ; disse to i sin tur deler en felles stamfar med B. lusitaniae . Alle tre arter splittet fra en felles stamfar de deler med B. afzelii , B. spielmanii , B. garinii og B. bavariensis . Denne gruppen av arter i sin tur splittet fra en felles stamfar delt med B. valaisiana . Det er viktig å merke seg at dette fylogenetiske treet kan godt endre seg i fremtiden som ny data kommer frem i lyset . Spesielt er det fullt mulig at den synkende kostnadene for genomsekvensering kan påvirke måten fylogenetiske trær er utviklet for bakterier som B. burgdorferi .